Зона, находящаяся выше зеркала воды, также подвержена агрессивным воздействиям, поскольку кислотные окислы во влажной атмосфере растворяются в конденсате, оседающем на стенках и на перекрытии септика. Образование конденсата можно уменьшить проще всего путем устройства теплоизоляции перекрытия, например путем засыпки его землей. 
Эффективным мероприятием по борьбе с коррозией является эпизодическое известкование содержимого ямы, благодаря чему происходит нейтрализация агрессивных кислот. Перегородки, разделяющие септик на отдельные камеры, выполняются обычно не столь массивными по сравнению со стенками септика, поскольку они не воспринимают никакого давления грунта и воды.
Однако они с обеих сторон подвергаются агрессивным воздействиям, поэтому рекомендуется делать эти перегородки такой же толщины, как и наружные стенки, т. е. устраивать кирпичные перегородки толщиной 25 и бетонные толщиной 20 см. Для обеспечения необходимой прочности вполне достаточно устройство стенки толщиной 12 см при условии, что камеры заполнены водой на одинаковую высоту.
Днище ямы следует выполнять таким же плотным, как и стены. При высоком уровне грунтовых вод, что приводит к образованию подъемной силы, днище следует армировать стальной арматурой. Кроме того, в зоне залегания грунтовых вод предусматривается дополнительная гидроизоляция септика из двух-трех слоев рубероида, наклеиваемых друг на друга.
Перекрытие септика должно быть рассчитано на выдерживание нагрузки от засыпки землей. Если оно устраивается из бетонных плит шириной от 20 до 25 см, то в таких плитах с нижней стороны предусматривается стальная арматура. Толщина защитного слоя арматуры должна составлять не менее 3 см, чтобы сталь под воздействием влаги не подвергалась коррозии. Кроме того, на нижнюю сторону плит наносится слой битума. Швы между плитами перекрытия заделываются цементным раствором, за исключением швов между теми плитами, которые эпизодически поднимают при удалении ила.
